Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRADDQ15628 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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