Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT31Q15323 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms