Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD6Q15008 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms