Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
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NFIXQ14938 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
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NFIXQ14938 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
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NFIXQ14938 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
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NFIXQ14938 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFIXQ14938 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NFIXQ14938 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFIXQ14938 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NFIXQ14938 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NFIXQ14938 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NFIXQ14938 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
NFIXQ14938 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NFIXQ14938 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFIXQ14938 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NFIXQ14938 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NFIXQ14938 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NFIXQ14938 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NFIXQ14938 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NFIXQ14938 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NFIXQ14938 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFIXQ14938 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NFIXQ14938 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NFIXQ14938 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFIXQ14938 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFIXQ14938 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NFIXQ14938 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NFIXQ14938 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NFIXQ14938 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFIXQ14938 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFIXQ14938 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFIXQ14938 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NFIXQ14938 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFIXQ14938 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NFIXQ14938 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFIXQ14938 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFIXQ14938 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
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