Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IHHQ14623 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IHHQ14623 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IHHQ14623 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IHHQ14623 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IHHQ14623 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IHHQ14623 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IHHQ14623 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IHHQ14623 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IHHQ14623 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IHHQ14623 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IHHQ14623 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IHHQ14623 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IHHQ14623 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IHHQ14623 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IHHQ14623 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IHHQ14623 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IHHQ14623 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IHHQ14623 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IHHQ14623 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IHHQ14623 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IHHQ14623 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IHHQ14623 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IHHQ14623 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IHHQ14623 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IHHQ14623 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IHHQ14623 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IHHQ14623 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IHHQ14623 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IHHQ14623 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IHHQ14623 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IHHQ14623 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IHHQ14623 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IHHQ14623 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IHHQ14623 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IHHQ14623 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IHHQ14623 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IHHQ14623 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IHHQ14623 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IHHQ14623 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IHHQ14623 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IHHQ14623 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IHHQ14623 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IHHQ14623 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IHHQ14623 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IHHQ14623 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IHHQ14623 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IHHQ14623 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IHHQ14623 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IHHQ14623 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IHHQ14623 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IHHQ14623 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IHHQ14623 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IHHQ14623 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IHHQ14623 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IHHQ14623 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IHHQ14623 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IHHQ14623 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IHHQ14623 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IHHQ14623 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IHHQ14623 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IHHQ14623 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IHHQ14623 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IHHQ14623 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IHHQ14623 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IHHQ14623 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IHHQ14623 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IHHQ14623 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IHHQ14623 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IHHQ14623 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IHHQ14623 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IHHQ14623 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IHHQ14623 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IHHQ14623 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IHHQ14623 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IHHQ14623 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IHHQ14623 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IHHQ14623 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IHHQ14623 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IHHQ14623 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IHHQ14623 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IHHQ14623 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IHHQ14623 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IHHQ14623 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IHHQ14623 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IHHQ14623 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IHHQ14623 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IHHQ14623 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IHHQ14623 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IHHQ14623 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IHHQ14623 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IHHQ14623 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IHHQ14623 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IHHQ14623 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IHHQ14623 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IHHQ14623 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IHHQ14623 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IHHQ14623 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IHHQ14623 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IHHQ14623 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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