Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARB2Q14108 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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