Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP1Q13829 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP1Q13829 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
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