Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1SQ13698 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
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