Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRR1Q13601 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRR1Q13601 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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