Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.015e-7■■■■■ 30.2
PABPC4Q13310 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.831e-15■■■■■ 30.2
PABPC4Q13310 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.971e-15■■■■■ 30.2
PABPC4Q13310 EZH2-209ENST00000492143 3641 ntTSL 217.68■□□□□ 0.421e-15■■■■■ 30.2
PABPC4Q13310 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.161e-15■■■■■ 30.2
PABPC4Q13310 EZH2-205ENST00000476773 2572 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.751e-15■■■■■ 30.2
PABPC4Q13310 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.061e-15■■■■■ 30.2
PABPC4Q13310 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.314e-7■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 EML2-205ENST00000586195 1952 ntTSL 223■■□□□ 1.274e-7■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 EML2-215ENST00000588308 2062 ntTSL 221.93■■□□□ 1.14e-7■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.074e-7■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 PYGB-201ENST00000216962 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.671e-8■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 AAMP-210ENST00000494720 1134 ntTSL 227.03■■□□□ 1.928e-15■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.298e-15■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.212e-7■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.481e-11■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 RGS14-202ENST00000425155 2329 ntTSL 221.33■■□□□ 11e-11■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.841e-11■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.641e-11■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.641e-11■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 AIMP2-204ENST00000415999 777 ntTSL 317.98■□□□□ 0.471e-11■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 AIMP2-203ENST00000400479 1107 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.11e-11■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 AFMID-202ENST00000409257 1730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.521e-11■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 HEXB-204ENST00000505859 604 ntTSL 310.95□□□□□ -0.661e-11■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 HEXB-202ENST00000503312 756 ntTSL 510.35□□□□□ -0.751e-11■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 HEXB-211ENST00000513539 502 ntTSL 39.98□□□□□ -0.811e-11■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 HEXB-210ENST00000513336 720 ntTSL 39.95□□□□□ -0.821e-11■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 HEXB-205ENST00000509579 806 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.821e-11■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 HEXB-212ENST00000513867 711 ntTSL 26.44□□□□□ -1.381e-11■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.483e-12■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.483e-12■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.333e-12■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.813e-12■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.813e-12■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.583e-12■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 RPS5-206ENST00000598807 970 ntTSL 220.33■□□□□ 0.851e-20■■■■■ 30.1
PABPC4Q13310 UBE2V2-207ENST00000523111 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.926e-7■■■■■ 30
PABPC4Q13310 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.14e-9■■■■■ 30
PABPC4Q13310 VRK3-202ENST00000377011 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.14e-9■■■■■ 30
PABPC4Q13310 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.935e-8■■■■■ 30
PABPC4Q13310 SMG7-212ENST00000507469 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.341e-10■■■■■ 30
PABPC4Q13310 SMG7-201ENST00000347615 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.561e-10■■■■■ 30
PABPC4Q13310 SMG7-215ENST00000515829 5629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.611e-10■■■■■ 30
PABPC4Q13310 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.921e-10■■■■■ 30
PABPC4Q13310 SMG7-209ENST00000495321 556 ntTSL 38.26□□□□□ -1.091e-10■■■■■ 30
PABPC4Q13310 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 09e-7■■■■■ 30
PABPC4Q13310 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.666e-8■■■■■ 30
PABPC4Q13310 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.16e-9■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 DHCR24-203ENST00000535035 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.536e-9■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 ECH1-203ENST00000594391 919 ntTSL 520.43■□□□□ 0.868e-10■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 ECH1-215ENST00000601333 710 ntTSL 217.37■□□□□ 0.378e-10■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.048e-10■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.286e-10■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.26e-10■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.662e-12■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.56e-10■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.156e-10■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.636e-10■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.612e-10■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 MVB12A-202ENST00000524382 908 ntTSL 223.59■■□□□ 1.372e-10■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 MVB12A-213ENST00000594784 705 ntTSL 523.52■■□□□ 1.362e-10■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.316e-8■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.892e-10■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.862e-10■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 ERMP1-203ENST00000462592 3554 ntTSL 218.06■□□□□ 0.486e-8■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 ERMP1-201ENST00000214893 4974 ntTSL 1 (best)11.36□□□□□ -0.596e-8■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 EXOSC4-203ENST00000527954 1065 ntTSL 218.44■□□□□ 0.547e-7■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.431e-24■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.574e-12■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.294e-12■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.174e-12■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 NDUFB10-203ENST00000565031 958 ntTSL 219.75■□□□□ 0.754e-12■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 NDUFB10-205ENST00000570172 495 ntTSL 313.51□□□□□ -0.254e-12■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 BCL7C-204ENST00000574418 1206 ntTSL 530.51■■■□□ 2.473e-7■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.33e-7■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.913e-7■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 BCL7C-203ENST00000572628 1603 ntTSL 1 (best)16.85■□□□□ 0.293e-7■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 AC135048.2-201ENST00000572471 561 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 29.9
PABPC4Q13310 PNPLA2-204ENST00000529255 1301 ntTSL 1 (best)20.8■□□□□ 0.922e-7■■■■■ 29.8
PABPC4Q13310 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.882e-7■■■■■ 29.8
PABPC4Q13310 PNPLA2-202ENST00000525250 2726 ntTSL 219.88■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 29.8
PABPC4Q13310 RPL41-206ENST00000552314 595 ntTSL 211.25□□□□□ -0.612e-55■■■■■ 29.8
PABPC4Q13310 VPS51-216ENST00000534591 1503 ntTSL 519.14■□□□□ 0.656e-14■■■■■ 29.8
PABPC4Q13310 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.311e-18■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 MIR4435-2HG-201ENST00000308604 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.111e-18■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 MIR4435-2HG-216ENST00000603827 1587 nt12.62□□□□□ -0.391e-18■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 MIR4435-2HG-212ENST00000444301 666 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.421e-18■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 MIR4435-2HG-217ENST00000604981 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.721e-18■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 MIR4435-2HG-210ENST00000442293 546 ntTSL 510.42□□□□□ -0.741e-18■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 MIR4435-2HG-211ENST00000443467 826 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.911e-18■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 MIR4435-2HG-205ENST00000431385 843 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.921e-18■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC9.07□□□□□ -0.961e-18■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.011e-18■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 MIR4435-2HG-215ENST00000603310 413 ntTSL 1 (best)8.77□□□□□ -1.011e-18■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.211e-18■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.281e-18■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.371e-18■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 DPP9-201ENST00000262960 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 29.7
PABPC4Q13310 DPP9-203ENST00000594671 3851 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 29.7
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