Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP4Q13115 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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