Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHAF1AQ13111 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms