Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXF1Q12946 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXF1Q12946 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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