Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMAN2Q12907 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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