Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCB1Q12824 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCB1Q12824 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCB1Q12824 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCB1Q12824 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCB1Q12824 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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