Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 GPI15YNL038W 690 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YSF3YNL138W-A 258 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 BRX1YOL077C 876 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 MRPS16YPL013C 366 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 RPN7YPR108W 1290 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 NHA1YLR138W 2958 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 PKC1YBL105C 3456 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 RAD30YDR419W 1899 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 MMT2YPL224C 1455 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 BZZ1YHR114W 1902 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 CDC37YDR168W 1521 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 TSC13YDL015C 933 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YDR187CYDR187C 519 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 PEA2YER149C 1263 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 NAT2YGR147C 867 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 MET14YKL001C 609 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 PIR3YKL163W 978 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YKR011CYKR011C 1062 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 ATG3YNR007C 933 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 snR3snR3 194 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 TAE1YBR261C 699 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 GEX1YCL073C 1848 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 AGE1YDR524C 1449 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 TFA1YKL028W 1449 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YIL067CYIL067C 2037 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 ATG4YNL223W 1485 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 PDH1YPR002W 1551 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YDR199WYDR199W 366 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 TPM2YIL138C 486 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 ACF4YJR083C 930 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 SYC1YOR179C 567 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 GPX2YBR244W 489 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 PRI2YKL045W 1587 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 SRP101YDR292C 1866 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YPK2YMR104C 2034 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 SSK22YCR073C 3996 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 IMG1YCR046C 510 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 RPL35BYDL136W 363 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 AIM7YDR063W 450 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YER145C-AYER145C-A 438 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 BIG1YHR101C 1008 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 EFM4YIL064W 774 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YJR087WYJR087W 351 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YML047W-AYML047W-A 366 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 RCM1YNL022C 1473 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 ATP1YBL099W 1638 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 AVO1YOL078W 3531 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 IFM1YOL023W 2031 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 BOP2YLR267W 1713 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 LTV1YKL143W 1392 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 MAK31YCR020C-A 267 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 CDC50YCR094W 1176 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 GIR2YDR152W 798 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 UBC1YDR177W 648 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 CCP1YKR066C 1086 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 IMP1YMR150C 573 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 NGL1YOL042W 1092 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 ATG1YGL180W 2694 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 BDP1YNL039W 1785 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 UGA3YDL170W 1587 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 ARP4YJL081C 1470 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 TRE2YOR256C 2430 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 CDC40YDR364C 1368 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 RIM1YCR028C-A 408 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 RPS2YGL123W 765 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 PHB1YGR132C 864 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 HAP3YBL021C 435 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 TBF1YPL128C 1689 nt5.34□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YMR155WYMR155W 1644 nt5.34□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 ACA1YER045C 1470 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 DIA3YDL024C 1407 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YDL057WYDL057W 987 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 UBC13YDR092W 462 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 SDC1YDR469W 528 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YAP3YHL009C 993 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 PAU17YLL025W 375 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 BMT2YBR141C 1014 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 HIS7YBR248C 1659 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 GPB2YAL056W 2643 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 MSA1YOR066W 1890 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 SLF1YDR515W 1344 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 ASA1YPR085C 1332 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YEL020CYEL020C 1683 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 ATG31YDR022C 591 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YDR269CYDR269C 324 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 GUK1YDR454C 564 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 RPL40BYKR094C 387 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YPT7YML001W 627 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 YMR252CYMR252C 405 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 TOM22YNL131W 459 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-NL1Q12391 OPY1YBR129C 987 nt5.32□□□□□ -1.56
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