Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 NAT1YDL040C 2565 nt4.07□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 PRM1YNL279W 1986 nt4.06□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 SOL4YGR248W 768 nt4.06□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 CAP2YIL034C 864 nt4.06□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 YIL089WYIL089W 618 nt4.06□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 YIL165CYIL165C 360 nt4.06□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 CDA2YLR308W 939 nt4.06□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 ARG80YMR042W 534 nt4.06□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 YBL059WYBL059W 582 nt4.06□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 MCK1YNL307C 1128 nt4.06□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 YOR186WYOR186W 435 nt4.06□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 RRP36YOR287C 903 nt4.06□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt4.06□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 APL4YPR029C 2499 nt4.06□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 ATG21YPL100W 1491 nt4.05□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 FLC1YPL221W 2382 nt4.05□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 HMS1YOR032C 1305 nt4.05□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 MNT4YNR059W 1743 nt4.05□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 LOH1YJL038C 660 nt4.05□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 YAR023CYAR023C 540 nt4.05□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 STP22YCL008C 1158 nt4.05□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 NOP58YOR310C 1536 nt4.05□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 FLO10YKR102W 3510 nt4.04□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 MSS2YDL107W 1056 nt4.04□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 YER145C-AYER145C-A 438 nt4.04□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 SOP4YJL192C 705 nt4.04□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 MED7YOL135C 669 nt4.04□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 REG2YBR050C 1017 nt4.04□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 RNT1YMR239C 1416 nt4.04□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 ZDS1YMR273C 2748 nt4.03□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 MLH2YLR035C 2088 nt4.03□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 VID27YNL212W 2349 nt4.03□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 NUP42YDR192C 1293 nt4.03□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 JAC1YGL018C 555 nt4.03□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 PDX1YGR193C 1233 nt4.03□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 PCL1YNL289W 840 nt4.03□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 YIL001WYIL001W 1542 nt4.03□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 YJR030CYJR030C 2238 nt4.03□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 YBR238CYBR238C 2196 nt4.03□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 TPA1YER049W 1935 nt4.02□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 YCR007CYCR007C 720 nt4.02□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 MED2YDL005C 1296 nt4.02□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 PHM6YDR281C 315 nt4.02□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt4.02□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 BAT2YJR148W 1131 nt4.02□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 YMR084WYMR084W 789 nt4.02□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 IST1YNL265C 897 nt4.02□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 SPS4YOR313C 1017 nt4.02□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 MGR2YPL098C 342 nt4.02□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 OPY1YBR129C 987 nt4.02□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 CTK1YKL139W 1587 nt4.02□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 EMC1YCL045C 2283 nt4.01□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 RPB2YOR151C 3675 nt4.01□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 THI13YDL244W 1023 nt4.01□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 RPC11YDR045C 333 nt4.01□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 HSP31YDR533C 714 nt4.01□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 THI11YJR156C 1023 nt4.01□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 MTR2YKL186C 555 nt4.01□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 TAF4YMR005W 1167 nt4.01□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 TMC1YOR052C 453 nt4.01□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 TMA16YOR252W 537 nt4.01□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 PNG1YPL096W 1092 nt4.01□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 BMT2YBR141C 1014 nt4.01□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 SMI1YGR229C 1518 nt4□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 MCM21YDR318W 1107 nt4□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 TOS8YGL096W 831 nt4□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 SSO2YMR183C 888 nt4□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt4□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 PBN1YCL052C 1251 nt4□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 PEX1YKL197C 3132 nt4□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 YVC1YOR087W 2028 nt4□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 UTP25YIL091C 2166 nt4□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 ERB1YMR049C 2424 nt4□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 YFL040WYFL040W 1623 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 ABD1YBR236C 1311 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 TEL1YBL088C 8364 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 YDR161WYDR161W 1164 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 HAT2YEL056W 1206 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 SCL1YGL011C 759 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 SPT4YGR063C 309 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 YGR219WYGR219W 342 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 YAR070CYAR070C 300 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 CDC73YLR418C 1182 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 YBL081WYBL081W 1107 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 ECM23YPL021W 564 nt3.99□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 MEF1YLR069C 2286 nt3.98□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 AGA1YNR044W 2178 nt3.98□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 YHL026CYHL026C 948 nt3.98□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 SPO16YHR153C 597 nt3.98□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 RPB3YIL021W 957 nt3.98□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt3.98□□□□□ -1.77
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