Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 PRP9YDL030W 1593 nt4.16□□□□□ -1.74
SLM3Q12093 SAP155YFR040W 3009 nt4.16□□□□□ -1.74
SLM3Q12093 PAN5YHR063C 1140 nt4.16□□□□□ -1.74
SLM3Q12093 YRA2YKL214C 612 nt4.16□□□□□ -1.74
SLM3Q12093 GOT1YMR292W 417 nt4.16□□□□□ -1.74
SLM3Q12093 NCE103YNL036W 666 nt4.16□□□□□ -1.74
SLM3Q12093 TPM1YNL079C 600 nt4.16□□□□□ -1.74
SLM3Q12093 YNL320WYNL320W 855 nt4.16□□□□□ -1.74
SLM3Q12093 DSE3YOR264W 1293 nt4.16□□□□□ -1.74
SLM3Q12093 YHR202WYHR202W 1809 nt4.16□□□□□ -1.74
SLM3Q12093 YER147C-AYER147C-A 411 nt4.15□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 YKR075CYKR075C 924 nt4.15□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 RPS0BYLR048W 759 nt4.15□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 MED7YOL135C 669 nt4.15□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 DEG1YFL001W 1329 nt4.15□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 GAL11YOL051W 3246 nt4.15□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 FLO5YHR211W 3228 nt4.14□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 BIO2YGR286C 1128 nt4.14□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.14□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 MHO1YJR008W 1017 nt4.14□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 PPA2YMR267W 933 nt4.14□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 ISA2YPR067W 558 nt4.14□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 RFT1YBL020W 1725 nt4.14□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 PIM1YBL022C 3402 nt4.14□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 ALA1YOR335C 2877 nt4.13□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 NFI1YOR156C 2181 nt4.13□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 TMN2YDR107C 2019 nt4.13□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 KRS1YDR037W 1776 nt4.13□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 BMH2YDR099W 822 nt4.13□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 RTN1YDR233C 888 nt4.13□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 YGL262WYGL262W 528 nt4.13□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 YAL004WYAL004W 648 nt4.13□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 YLR124WYLR124W 345 nt4.13□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 SNT1YCR033W 3681 nt4.13□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 NTO1YPR031W 2247 nt4.12□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 YDL183CYDL183C 963 nt4.12□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 MRPL11YDL202W 750 nt4.12□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 YHL026CYHL026C 948 nt4.12□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 PPX1YHR201C 1194 nt4.12□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 ARC15YIL062C 465 nt4.12□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 RIM9YMR063W 720 nt4.12□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 YPL071CYPL071C 471 nt4.12□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 YPL073CYPL073C 486 nt4.12□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 STE6YKL209C 3873 nt4.12□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 LDB17YDL146W 1476 nt4.11□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 SPT15YER148W 723 nt4.11□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 MRPS35YGR165W 1038 nt4.11□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 YLR402WYLR402W 192 nt4.11□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 GCN5YGR252W 1320 nt4.11□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 YBR139WYBR139W 1527 nt4.11□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 FAA3YIL009W 2085 nt4.1□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 THI22YPR121W 1719 nt4.1□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 ESF1YDR365C 1887 nt4.1□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 YEL057CYEL057C 702 nt4.1□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 YER084WYER084W 387 nt4.1□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 BCD1YHR040W 1101 nt4.1□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 IRC9YJL142C 393 nt4.1□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 YJR128WYJR128W 360 nt4.1□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt4.1□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 YLR346CYLR346C 306 nt4.1□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 YBL081WYBL081W 1107 nt4.1□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 TGL3YMR313C 1929 nt4.1□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 YMR317WYMR317W 3423 nt4.1□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 PPZ1YML016C 2079 nt4.1□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 HPC2YBR215W 1878 nt4.09□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 HAT2YEL056W 1206 nt4.09□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 RPL34AYER056C-A 366 nt4.09□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 DSD1YGL196W 1287 nt4.09□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 YLR036CYLR036C 612 nt4.09□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 SNO1YMR095C 675 nt4.09□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 AVT7YIL088C 1473 nt4.09□□□□□ -1.75
SLM3Q12093 DNM1YLL001W 2274 nt4.09□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 SEG2YKL105C 3399 nt4.08□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 PFA5YDR459C 1125 nt4.08□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 NVJ1YHR195W 966 nt4.08□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 RPS31YLR167W 459 nt4.08□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 COX14YML129C 213 nt4.08□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 GRE1YPL223C 507 nt4.08□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 SUI3YPL237W 858 nt4.08□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 REC8YPR007C 2043 nt4.08□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt4.08□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 VHC1YBR235W 3363 nt4.08□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 PRP43YGL120C 2304 nt4.07□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 GAS2YLR343W 1668 nt4.07□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 SOF1YLL011W 1470 nt4.07□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 VID28YIL017C 2766 nt4.07□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 PPH3YDR075W 927 nt4.07□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 MOB2YFL034C-B 864 nt4.07□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 TEM1YML064C 738 nt4.07□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt4.07□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 MET10YFR030W 3108 nt4.07□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 GPR1YDL035C 2886 nt4.07□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 ARO1YDR127W 4767 nt4.07□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 UBC1YDR177W 648 nt4.06□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 REE1YJL217W 597 nt4.06□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 PRM9YAR031W 897 nt4.06□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 RPS12YOR369C 432 nt4.06□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 NRG2YBR066C 663 nt4.06□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt4.06□□□□□ -1.76
SLM3Q12093 TYW1YPL207W 2433 nt4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.4 ms