Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt6.76□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YIL161WYIL161W 708 nt6.76□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 IMP2YMR035W 534 nt6.76□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 ZPS1YOL154W 750 nt6.76□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YPL225WYPL225W 441 nt6.76□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 ERV15YBR210W 429 nt6.76□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YDR131CYDR131C 1671 nt6.76□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 UTP18YJL069C 1785 nt6.76□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 SEC18YBR080C 2277 nt6.76□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 FLC2YAL053W 2352 nt6.76□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YFR006WYFR006W 1608 nt6.76□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YDR444WYDR444W 2064 nt6.75□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 MKC7YDR144C 1791 nt6.75□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YCR041WYCR041W 333 nt6.75□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 AAD3YCR107W 1092 nt6.75□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 GCN4YEL009C 846 nt6.75□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 HEM2YGL040C 1029 nt6.75□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 EFM4YIL064W 774 nt6.75□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YIL175WYIL175W 318 nt6.75□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YLR297WYLR297W 390 nt6.75□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YNL200CYNL200C 741 nt6.75□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YNR005CYNR005C 405 nt6.75□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 GAL80YML051W 1308 nt6.75□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 SAS10YDL153C 1833 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 UBC1YDR177W 648 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 MET32YDR253C 576 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 LIF1YGL090W 1266 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 LSB1YGR136W 726 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 RRP4YHR069C 1080 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 CDC12YHR107C 1224 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 MAM33YIL070C 801 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YLR290CYLR290C 834 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 RAD33YML011C 534 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 FPR3YML074C 1236 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 SCS22YBL091C-A 528 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 MHP1YJL042W 4197 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 SIT1YEL065W 1887 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 MSA1YOR066W 1890 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 MKK1YOR231W 1527 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YDR387CYDR387C 1668 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 CUE2YKL090W 1332 nt6.74□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 PXL1YKR090W 2121 nt6.73□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 ALD2YMR170C 1521 nt6.73□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 VMA8YEL051W 771 nt6.73□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YGL260WYGL260W 231 nt6.73□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YGR073CYGR073C 372 nt6.73□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YKL147CYKL147C 618 nt6.73□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YKL153WYKL153W 510 nt6.73□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 ICY2YPL250C 411 nt6.73□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 GLN1YPR035W 1113 nt6.73□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 snR3snR3 194 nt6.73□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 FMP40YPL222W 2067 nt6.73□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 RIX7YLL034C 2514 nt6.72□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 GET1YGL020C 708 nt6.72□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YNL019CYNL019C 855 nt6.72□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YNL033WYNL033W 855 nt6.72□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 ATP11YNL315C 957 nt6.72□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 snR17asnR17a 333 nt6.72□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 RPL43AYPR043W 279 nt6.72□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 YIL067CYIL067C 2037 nt6.72□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 TRE2YOR256C 2430 nt6.71□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 TIP20YGL145W 2106 nt6.71□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 SDA1YGR245C 2304 nt6.71□□□□□ -1.33
TFB4Q12004 snR82snR82 268 nt6.71□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 SLD5YDR489W 885 nt6.71□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 CHZ1YER030W 462 nt6.71□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 YIP1YGR172C 747 nt6.71□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 SPL2YHR136C 447 nt6.71□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 YJR020WYJR020W 333 nt6.71□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 HIT1YJR055W 495 nt6.71□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 YLR224WYLR224W 1110 nt6.71□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 MCK1YNL307C 1128 nt6.71□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 COQ10YOL008W 624 nt6.71□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 YOR053WYOR053W 342 nt6.71□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 RDR1YOR380W 1641 nt6.71□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 SMF1YOL122C 1728 nt6.7□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 snR5snR5 204 nt6.7□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 BNA7YDR428C 786 nt6.7□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 YER097WYER097W 330 nt6.7□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt6.7□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 ASF1YJL115W 840 nt6.7□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 YKR032WYKR032W 315 nt6.7□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 LOT6YLR011W 576 nt6.7□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 RLP7YNL002C 969 nt6.7□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 TMA46YOR091W 1038 nt6.7□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 MCM16YPR046W 546 nt6.7□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 ASA1YPR085C 1332 nt6.7□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 CRH1YGR189C 1524 nt6.7□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 BDP1YNL039W 1785 nt6.69□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 NUP1YOR098C 3231 nt6.69□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 NTE1YML059C 5040 nt6.69□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 YDL071CYDL071C 375 nt6.69□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 RXT3YDL076C 885 nt6.69□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 SWF1YDR126W 1011 nt6.69□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt6.69□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 ABM1YJR108W 372 nt6.69□□□□□ -1.34
TFB4Q12004 LST8YNL006W 912 nt6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms