Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF543Q08ER8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF543Q08ER8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms