Protein–RNA interactions for Protein: Q07532

IWR1, RNA polymerase II nuclear localization protein IWR1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 353 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IWR1	Q07532	CNB1	YKL190W	528 nt		4.59	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	TVP38	YKR088C	1014 nt		4.59	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	YLR366W	YLR366W	306 nt		4.59	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	UAF30	YOR295W	687 nt		4.59	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	MFM1	YPL060W	1242 nt		4.59	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	GCR1	YPL075W	2358 nt		4.59	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	YND1	YER005W	1893 nt		4.58	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	GDH2	YDL215C	3279 nt		4.58	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	CDC6	YJL194W	1542 nt		4.58	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	OCA4	YCR095C	1089 nt		4.58	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	KRE28	YDR532C	1158 nt		4.58	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	GEP7	YGL057C	864 nt		4.58	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	LOH1	YJL038C	660 nt		4.58	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	MNN11	YJL183W	1269 nt		4.58	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	MMM1	YLL006W	1281 nt		4.58	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	RFU1	YLR073C	603 nt		4.58	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	ALE1	YOR175C	1860 nt		4.58	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	FLO8	YER109C	2400 nt		4.57	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	snR7-L	snR7-L	214 nt		4.57	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	TAF10	YDR167W	621 nt		4.57	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	YFR045W	YFR045W	930 nt		4.57	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	YAE1	YJR067C	426 nt		4.57	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	YUH1	YJR099W	711 nt		4.57	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	YRA2	YKL214C	612 nt		4.57	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	PML39	YML107C	1005 nt		4.57	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	YBR013C	YBR013C	390 nt		4.57	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	PNO1	YOR145C	825 nt		4.57	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	SLM4	YBR077C	489 nt		4.57	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	APA1	YCL050C	966 nt		4.57	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	SPB4	YFL002C	1821 nt		4.57	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	APP1	YNL094W	1764 nt		4.57	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	RPN4	YDL020C	1596 nt		4.57	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	FRE1	YLR214W	2061 nt		4.57	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	RPL34A	YER056C-A	366 nt		4.56	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	ISC10	YER180C	804 nt		4.56	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	YFR032C-B	YFR032C-B	264 nt		4.56	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	YGL177W	YGL177W	348 nt		4.56	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	MIC26	YGR235C	702 nt		4.56	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	PCL7	YIL050W	858 nt		4.56	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	SEC72	YLR292C	582 nt		4.56	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	MCK1	YNL307C	1128 nt		4.56	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	RFM1	YOR279C	933 nt		4.56	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	MET4	YNL103W	2019 nt		4.56	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	YDR261C-D	YDR261C-D	4815 nt		4.56	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	RAD52	YML032C	1416 nt		4.55	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	PST1	YDR055W	1335 nt		4.55	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	BUD13	YGL174W	801 nt		4.55	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	YGL218W	YGL218W	651 nt		4.55	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	YLR157W-D	YLR157W-D	213 nt		4.55	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	YLR407W	YLR407W	687 nt		4.55	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	YBL010C	YBL010C	843 nt		4.55	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	RIF2	YLR453C	1188 nt		4.55	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	TAF14	YPL129W	735 nt		4.55	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	PBI1	YPL272C	1554 nt		4.55	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	FAA3	YIL009W	2085 nt		4.55	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	CTT1	YGR088W	1689 nt		4.54	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	THS1	YIL078W	2205 nt		4.54	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	FRT2	YAL028W	1587 nt		4.54	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	HIM1	YDR317W	1245 nt		4.54	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	COX18	YGR062C	951 nt		4.54	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	YGR270C-A	YGR270C-A	219 nt		4.54	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	CDC42	YLR229C	576 nt		4.54	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	MEK1	YOR351C	1494 nt		4.54	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	MAK11	YKL021C	1407 nt		4.54	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	BCH2	YKR027W	2298 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	MEF1	YLR069C	2286 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	YRB30	YGL164C	1323 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	HOT1	YMR172W	2160 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	SBE2	YDR351W	2595 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	MSC7	YHR039C	1935 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	CUP1-1	YHR053C	186 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	CUP1-2	YHR055C	186 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	POL32	YJR043C	1053 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	PER33	YLR064W	822 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	GSP1	YLR293C	660 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	YML031C-A	YML031C-A	336 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	YBL062W	YBL062W	381 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	CUZ1	YNL155W	825 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	REX4	YOL080C	870 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	YOR062C	YOR062C	807 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	PLP2	YOR281C	861 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	INA17	YPL099C	549 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	STV1	YMR054W	2673 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	HFA1	YMR207C	6372 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	PHO87	YCR037C	2772 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	UBP10	YNL186W	2379 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	RAD16	YBR114W	2373 nt		4.53	□□□□□ -1.68
IWR1	Q07532	KTR6	YPL053C	1341 nt		4.52	□□□□□ -1.69
IWR1	Q07532	AVT1	YJR001W	1809 nt		4.52	□□□□□ -1.69
IWR1	Q07532	YDR056C	YDR056C	618 nt		4.52	□□□□□ -1.69
IWR1	Q07532	BNA6	YFR047C	888 nt		4.52	□□□□□ -1.69
IWR1	Q07532	ERG25	YGR060W	930 nt		4.52	□□□□□ -1.69
IWR1	Q07532	SAE3	YHR079C-A	276 nt		4.52	□□□□□ -1.69
IWR1	Q07532	EOS1	YNL080C	1101 nt		4.52	□□□□□ -1.69
IWR1	Q07532	FYV6	YNL133C	522 nt		4.52	□□□□□ -1.69
IWR1	Q07532	SUA7	YPR086W	1038 nt		4.52	□□□□□ -1.69
IWR1	Q07532	YBR255C-A	YBR255C-A	363 nt		4.52	□□□□□ -1.69
IWR1	Q07532	YBR292C	YBR292C	372 nt		4.52	□□□□□ -1.69
IWR1	Q07532	RRP7	YCL031C	894 nt		4.52	□□□□□ -1.69
IWR1	Q07532	HAP4	YKL109W	1665 nt		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.5 ms