Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CXCL9Q07325 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms