Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBQ06643 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LTBQ06643 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTBQ06643 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBQ06643 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBQ06643 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBQ06643 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBQ06643 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBQ06643 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBQ06643 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBQ06643 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBQ06643 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBQ06643 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBQ06643 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBQ06643 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTBQ06643 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBQ06643 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBQ06643 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBQ06643 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBQ06643 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBQ06643 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBQ06643 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBQ06643 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTBQ06643 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTBQ06643 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTBQ06643 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBQ06643 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBQ06643 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBQ06643 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBQ06643 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBQ06643 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBQ06643 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBQ06643 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBQ06643 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBQ06643 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBQ06643 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms