Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN11Q06124 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN11Q06124 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN11Q06124 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms