Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN12Q05209 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN12Q05209 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms