Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC37.07■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
TOP2BQ02880 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
TOP2BQ02880 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC37■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC37■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC37■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOP2BQ02880 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms