Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OC90Q02509 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OC90Q02509 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OC90Q02509 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OC90Q02509 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OC90Q02509 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OC90Q02509 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
OC90Q02509 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OC90Q02509 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OC90Q02509 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OC90Q02509 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OC90Q02509 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OC90Q02509 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OC90Q02509 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OC90Q02509 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OC90Q02509 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OC90Q02509 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OC90Q02509 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OC90Q02509 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OC90Q02509 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OC90Q02509 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
OC90Q02509 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
OC90Q02509 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
OC90Q02509 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OC90Q02509 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OC90Q02509 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OC90Q02509 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OC90Q02509 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OC90Q02509 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OC90Q02509 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OC90Q02509 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OC90Q02509 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OC90Q02509 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OC90Q02509 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OC90Q02509 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OC90Q02509 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OC90Q02509 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OC90Q02509 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OC90Q02509 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OC90Q02509 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OC90Q02509 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OC90Q02509 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OC90Q02509 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OC90Q02509 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OC90Q02509 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OC90Q02509 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OC90Q02509 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OC90Q02509 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
OC90Q02509 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OC90Q02509 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OC90Q02509 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
OC90Q02509 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OC90Q02509 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OC90Q02509 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OC90Q02509 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OC90Q02509 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OC90Q02509 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OC90Q02509 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
OC90Q02509 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OC90Q02509 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OC90Q02509 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OC90Q02509 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OC90Q02509 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OC90Q02509 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OC90Q02509 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OC90Q02509 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OC90Q02509 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OC90Q02509 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OC90Q02509 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OC90Q02509 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OC90Q02509 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OC90Q02509 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
OC90Q02509 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
OC90Q02509 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OC90Q02509 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OC90Q02509 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OC90Q02509 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OC90Q02509 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OC90Q02509 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OC90Q02509 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OC90Q02509 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OC90Q02509 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OC90Q02509 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OC90Q02509 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OC90Q02509 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OC90Q02509 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OC90Q02509 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OC90Q02509 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OC90Q02509 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OC90Q02509 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OC90Q02509 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OC90Q02509 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OC90Q02509 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OC90Q02509 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OC90Q02509 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OC90Q02509 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OC90Q02509 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OC90Q02509 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OC90Q02509 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OC90Q02509 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms