Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
XPCQ01831 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
XPCQ01831 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
XPCQ01831 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
XPCQ01831 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
XPCQ01831 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
XPCQ01831 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
XPCQ01831 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
XPCQ01831 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
XPCQ01831 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
XPCQ01831 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
XPCQ01831 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
XPCQ01831 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
XPCQ01831 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
XPCQ01831 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
XPCQ01831 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
XPCQ01831 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
XPCQ01831 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
XPCQ01831 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
XPCQ01831 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
XPCQ01831 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
XPCQ01831 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
XPCQ01831 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
XPCQ01831 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
XPCQ01831 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
XPCQ01831 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
XPCQ01831 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
XPCQ01831 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
XPCQ01831 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
XPCQ01831 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
XPCQ01831 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
XPCQ01831 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
XPCQ01831 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
XPCQ01831 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
XPCQ01831 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
XPCQ01831 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
XPCQ01831 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
XPCQ01831 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
XPCQ01831 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
XPCQ01831 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
XPCQ01831 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
XPCQ01831 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
XPCQ01831 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
XPCQ01831 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
XPCQ01831 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
XPCQ01831 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
XPCQ01831 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
XPCQ01831 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
XPCQ01831 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
XPCQ01831 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
XPCQ01831 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
XPCQ01831 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
XPCQ01831 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
XPCQ01831 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
XPCQ01831 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
XPCQ01831 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
XPCQ01831 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
XPCQ01831 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
XPCQ01831 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
XPCQ01831 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
XPCQ01831 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
XPCQ01831 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
XPCQ01831 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
XPCQ01831 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
XPCQ01831 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
XPCQ01831 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
XPCQ01831 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
XPCQ01831 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
XPCQ01831 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
XPCQ01831 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
XPCQ01831 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
XPCQ01831 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
XPCQ01831 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
XPCQ01831 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
XPCQ01831 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
XPCQ01831 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
XPCQ01831 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
XPCQ01831 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
XPCQ01831 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
XPCQ01831 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
XPCQ01831 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
XPCQ01831 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
XPCQ01831 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
XPCQ01831 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
XPCQ01831 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
XPCQ01831 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
XPCQ01831 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
XPCQ01831 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
XPCQ01831 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
XPCQ01831 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
XPCQ01831 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
XPCQ01831 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
XPCQ01831 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
XPCQ01831 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
XPCQ01831 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
XPCQ01831 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
XPCQ01831 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
XPCQ01831 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
XPCQ01831 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
XPCQ01831 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms