Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK17Q00537 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK17Q00537 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms