Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms