Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
HOXC5Q00444 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms