Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED6P86452 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms