Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKOR1P84550 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKOR1P84550 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms