Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms