Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN2AP68543 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms