Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOAP61586 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOAP61586 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOAP61586 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOAP61586 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOAP61586 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOAP61586 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOAP61586 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOAP61586 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOAP61586 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOAP61586 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOAP61586 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOAP61586 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOAP61586 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOAP61586 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOAP61586 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOAP61586 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOAP61586 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOAP61586 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOAP61586 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOAP61586 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOAP61586 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOAP61586 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOAP61586 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOAP61586 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOAP61586 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOAP61586 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOAP61586 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOAP61586 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOAP61586 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOAP61586 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOAP61586 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOAP61586 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOAP61586 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOAP61586 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOAP61586 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOAP61586 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOAP61586 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOAP61586 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOAP61586 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOAP61586 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOAP61586 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOAP61586 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOAP61586 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOAP61586 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOAP61586 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOAP61586 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOAP61586 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOAP61586 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOAP61586 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOAP61586 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOAP61586 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOAP61586 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOAP61586 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOAP61586 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOAP61586 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOAP61586 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOAP61586 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOAP61586 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOAP61586 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOAP61586 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOAP61586 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOAP61586 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOAP61586 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOAP61586 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOAP61586 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOAP61586 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOAP61586 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOAP61586 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOAP61586 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOAP61586 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOAP61586 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOAP61586 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOAP61586 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOAP61586 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOAP61586 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOAP61586 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOAP61586 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOAP61586 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOAP61586 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOAP61586 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOAP61586 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOAP61586 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOAP61586 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOAP61586 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOAP61586 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOAP61586 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOAP61586 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOAP61586 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOAP61586 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOAP61586 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOAP61586 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOAP61586 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOAP61586 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOAP61586 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOAP61586 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOAP61586 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOAP61586 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOAP61586 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOAP61586 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms