Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3EP60228 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3EP60228 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms