Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01547P58512 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms