Protein–RNA interactions for Protein: P57087

JAM2, Junctional adhesion molecule B, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM2P57087 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
JAM2P57087 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
JAM2P57087 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
JAM2P57087 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
JAM2P57087 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
JAM2P57087 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
JAM2P57087 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
JAM2P57087 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
JAM2P57087 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
JAM2P57087 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
JAM2P57087 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
JAM2P57087 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
JAM2P57087 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JAM2P57087 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JAM2P57087 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JAM2P57087 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JAM2P57087 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JAM2P57087 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
JAM2P57087 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
JAM2P57087 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
JAM2P57087 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JAM2P57087 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
JAM2P57087 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
JAM2P57087 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JAM2P57087 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
JAM2P57087 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
JAM2P57087 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
JAM2P57087 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
JAM2P57087 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
JAM2P57087 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
JAM2P57087 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
JAM2P57087 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
JAM2P57087 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
JAM2P57087 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
JAM2P57087 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
JAM2P57087 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
JAM2P57087 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
JAM2P57087 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
JAM2P57087 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
JAM2P57087 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
JAM2P57087 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
JAM2P57087 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
JAM2P57087 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
JAM2P57087 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
JAM2P57087 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
JAM2P57087 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
JAM2P57087 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
JAM2P57087 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
JAM2P57087 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
JAM2P57087 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
JAM2P57087 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
JAM2P57087 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
JAM2P57087 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
JAM2P57087 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
JAM2P57087 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
JAM2P57087 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
JAM2P57087 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
JAM2P57087 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
JAM2P57087 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
JAM2P57087 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
JAM2P57087 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
JAM2P57087 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
JAM2P57087 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
JAM2P57087 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
JAM2P57087 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
JAM2P57087 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
JAM2P57087 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
JAM2P57087 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
JAM2P57087 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
JAM2P57087 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
JAM2P57087 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
JAM2P57087 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
JAM2P57087 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
JAM2P57087 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
JAM2P57087 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
JAM2P57087 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
JAM2P57087 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
JAM2P57087 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
JAM2P57087 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
JAM2P57087 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
JAM2P57087 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
JAM2P57087 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
JAM2P57087 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
JAM2P57087 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
JAM2P57087 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
JAM2P57087 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
JAM2P57087 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
JAM2P57087 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
JAM2P57087 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
JAM2P57087 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
JAM2P57087 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
JAM2P57087 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
JAM2P57087 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
JAM2P57087 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
JAM2P57087 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
JAM2P57087 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
JAM2P57087 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
JAM2P57087 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
JAM2P57087 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
JAM2P57087 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms