Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP7P55210 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP7P55210 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP7P55210 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP7P55210 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP7P55210 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CASP7P55210 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP7P55210 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP7P55210 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP7P55210 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP7P55210 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP7P55210 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP7P55210 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP7P55210 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP7P55210 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP7P55210 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP7P55210 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP7P55210 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP7P55210 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP7P55210 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP7P55210 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP7P55210 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP7P55210 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP7P55210 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP7P55210 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP7P55210 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP7P55210 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP7P55210 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP7P55210 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP7P55210 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP7P55210 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP7P55210 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP7P55210 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP7P55210 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP7P55210 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP7P55210 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP7P55210 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP7P55210 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP7P55210 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP7P55210 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP7P55210 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP7P55210 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP7P55210 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP7P55210 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP7P55210 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP7P55210 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP7P55210 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP7P55210 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP7P55210 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASP7P55210 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASP7P55210 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASP7P55210 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASP7P55210 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASP7P55210 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASP7P55210 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP7P55210 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP7P55210 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP7P55210 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP7P55210 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP7P55210 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP7P55210 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP7P55210 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP7P55210 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP7P55210 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP7P55210 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP7P55210 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP7P55210 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP7P55210 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP7P55210 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP7P55210 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP7P55210 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP7P55210 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP7P55210 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP7P55210 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP7P55210 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP7P55210 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP7P55210 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP7P55210 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP7P55210 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP7P55210 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP7P55210 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP7P55210 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP7P55210 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP7P55210 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP7P55210 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP7P55210 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP7P55210 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP7P55210 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP7P55210 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP7P55210 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP7P55210 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP7P55210 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP7P55210 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP7P55210 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP7P55210 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP7P55210 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP7P55210 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP7P55210 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP7P55210 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP7P55210 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms