Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB3P54753 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms