Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATN1P54259 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATN1P54259 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATN1P54259 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATN1P54259 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATN1P54259 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATN1P54259 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATN1P54259 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATN1P54259 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATN1P54259 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATN1P54259 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATN1P54259 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATN1P54259 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATN1P54259 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATN1P54259 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATN1P54259 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATN1P54259 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATN1P54259 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATN1P54259 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATN1P54259 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATN1P54259 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATN1P54259 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATN1P54259 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATN1P54259 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATN1P54259 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATN1P54259 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATN1P54259 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATN1P54259 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATN1P54259 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATN1P54259 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATN1P54259 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATN1P54259 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATN1P54259 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATN1P54259 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATN1P54259 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATN1P54259 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATN1P54259 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATN1P54259 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATN1P54259 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATN1P54259 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATN1P54259 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATN1P54259 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATN1P54259 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATN1P54259 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATN1P54259 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATN1P54259 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATN1P54259 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATN1P54259 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATN1P54259 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATN1P54259 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATN1P54259 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATN1P54259 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATN1P54259 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATN1P54259 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATN1P54259 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATN1P54259 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATN1P54259 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATN1P54259 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATN1P54259 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATN1P54259 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATN1P54259 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATN1P54259 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATN1P54259 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATN1P54259 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATN1P54259 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATN1P54259 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATN1P54259 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATN1P54259 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATN1P54259 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATN1P54259 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATN1P54259 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATN1P54259 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATN1P54259 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATN1P54259 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATN1P54259 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATN1P54259 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATN1P54259 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATN1P54259 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATN1P54259 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATN1P54259 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATN1P54259 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATN1P54259 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATN1P54259 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATN1P54259 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATN1P54259 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATN1P54259 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATN1P54259 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATN1P54259 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATN1P54259 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATN1P54259 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATN1P54259 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATN1P54259 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATN1P54259 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATN1P54259 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATN1P54259 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATN1P54259 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATN1P54259 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATN1P54259 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATN1P54259 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATN1P54259 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms