Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST2P52849 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST2P52849 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST2P52849 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST2P52849 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST2P52849 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST2P52849 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST2P52849 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST2P52849 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST2P52849 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST2P52849 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST2P52849 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST2P52849 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST2P52849 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST2P52849 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST2P52849 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NDST2P52849 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST2P52849 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST2P52849 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST2P52849 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST2P52849 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST2P52849 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST2P52849 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST2P52849 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST2P52849 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST2P52849 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST2P52849 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST2P52849 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST2P52849 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST2P52849 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST2P52849 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST2P52849 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST2P52849 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST2P52849 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST2P52849 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST2P52849 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST2P52849 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST2P52849 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST2P52849 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST2P52849 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST2P52849 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST2P52849 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST2P52849 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST2P52849 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST2P52849 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST2P52849 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST2P52849 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST2P52849 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST2P52849 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST2P52849 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST2P52849 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST2P52849 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST2P52849 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST2P52849 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST2P52849 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST2P52849 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST2P52849 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST2P52849 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST2P52849 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST2P52849 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST2P52849 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST2P52849 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST2P52849 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST2P52849 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST2P52849 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST2P52849 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST2P52849 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST2P52849 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST2P52849 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST2P52849 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST2P52849 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST2P52849 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST2P52849 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST2P52849 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST2P52849 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST2P52849 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST2P52849 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST2P52849 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST2P52849 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST2P52849 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST2P52849 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST2P52849 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST2P52849 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST2P52849 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST2P52849 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST2P52849 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST2P52849 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST2P52849 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST2P52849 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST2P52849 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST2P52849 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST2P52849 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST2P52849 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST2P52849 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST2P52849 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST2P52849 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST2P52849 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDST2P52849 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDST2P52849 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDST2P52849 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms