Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2A2P52657 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms