Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SSR4P51571 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSR4P51571 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SSR4P51571 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSR4P51571 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSR4P51571 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSR4P51571 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSR4P51571 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSR4P51571 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSR4P51571 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSR4P51571 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSR4P51571 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSR4P51571 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSR4P51571 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSR4P51571 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSR4P51571 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSR4P51571 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSR4P51571 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSR4P51571 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSR4P51571 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSR4P51571 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSR4P51571 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSR4P51571 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSR4P51571 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSR4P51571 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSR4P51571 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSR4P51571 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSR4P51571 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSR4P51571 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSR4P51571 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSR4P51571 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSR4P51571 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR4P51571 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR4P51571 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR4P51571 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR4P51571 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR4P51571 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR4P51571 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR4P51571 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR4P51571 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR4P51571 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR4P51571 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR4P51571 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR4P51571 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR4P51571 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR4P51571 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR4P51571 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR4P51571 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR4P51571 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR4P51571 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR4P51571 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR4P51571 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR4P51571 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR4P51571 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR4P51571 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR4P51571 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR4P51571 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR4P51571 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR4P51571 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR4P51571 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR4P51571 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR4P51571 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR4P51571 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR4P51571 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR4P51571 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR4P51571 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR4P51571 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR4P51571 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR4P51571 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR4P51571 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR4P51571 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR4P51571 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR4P51571 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR4P51571 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR4P51571 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR4P51571 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR4P51571 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR4P51571 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR4P51571 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR4P51571 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR4P51571 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR4P51571 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR4P51571 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR4P51571 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR4P51571 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR4P51571 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR4P51571 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR4P51571 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR4P51571 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR4P51571 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR4P51571 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR4P51571 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR4P51571 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSR4P51571 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSR4P51571 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSR4P51571 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSR4P51571 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSR4P51571 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSR4P51571 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSR4P51571 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms