Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCNN1BP51168 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCNN1BP51168 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms