Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRIM1P49642 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms