Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK8P49336 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK8P49336 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK8P49336 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK8P49336 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK8P49336 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK8P49336 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK8P49336 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK8P49336 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK8P49336 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK8P49336 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK8P49336 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK8P49336 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK8P49336 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK8P49336 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK8P49336 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK8P49336 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK8P49336 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK8P49336 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK8P49336 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK8P49336 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK8P49336 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK8P49336 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK8P49336 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK8P49336 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK8P49336 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK8P49336 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK8P49336 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK8P49336 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK8P49336 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK8P49336 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK8P49336 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK8P49336 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK8P49336 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK8P49336 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK8P49336 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK8P49336 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDK8P49336 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK8P49336 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK8P49336 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK8P49336 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK8P49336 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK8P49336 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK8P49336 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK8P49336 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK8P49336 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK8P49336 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK8P49336 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK8P49336 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK8P49336 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK8P49336 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK8P49336 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK8P49336 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK8P49336 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK8P49336 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK8P49336 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK8P49336 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK8P49336 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK8P49336 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK8P49336 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK8P49336 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK8P49336 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK8P49336 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK8P49336 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK8P49336 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK8P49336 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK8P49336 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK8P49336 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK8P49336 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK8P49336 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK8P49336 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK8P49336 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK8P49336 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK8P49336 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK8P49336 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK8P49336 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK8P49336 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK8P49336 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK8P49336 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK8P49336 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK8P49336 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK8P49336 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK8P49336 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK8P49336 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK8P49336 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK8P49336 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK8P49336 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK8P49336 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK8P49336 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK8P49336 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK8P49336 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK8P49336 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK8P49336 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK8P49336 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK8P49336 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK8P49336 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK8P49336 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK8P49336 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK8P49336 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK8P49336 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms