Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCAMP43121 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCAMP43121 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MCAMP43121 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MCAMP43121 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MCAMP43121 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCAMP43121 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MCAMP43121 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MCAMP43121 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCAMP43121 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCAMP43121 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCAMP43121 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCAMP43121 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCAMP43121 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCAMP43121 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCAMP43121 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCAMP43121 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCAMP43121 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCAMP43121 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCAMP43121 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCAMP43121 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCAMP43121 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCAMP43121 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCAMP43121 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCAMP43121 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCAMP43121 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCAMP43121 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCAMP43121 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCAMP43121 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCAMP43121 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCAMP43121 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCAMP43121 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCAMP43121 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MCAMP43121 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCAMP43121 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCAMP43121 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCAMP43121 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCAMP43121 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCAMP43121 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCAMP43121 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCAMP43121 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCAMP43121 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCAMP43121 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCAMP43121 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCAMP43121 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCAMP43121 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCAMP43121 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCAMP43121 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MCAMP43121 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCAMP43121 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCAMP43121 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCAMP43121 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCAMP43121 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCAMP43121 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCAMP43121 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCAMP43121 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCAMP43121 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCAMP43121 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCAMP43121 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCAMP43121 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCAMP43121 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCAMP43121 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCAMP43121 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCAMP43121 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCAMP43121 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCAMP43121 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCAMP43121 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MCAMP43121 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MCAMP43121 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCAMP43121 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCAMP43121 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCAMP43121 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCAMP43121 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MCAMP43121 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCAMP43121 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCAMP43121 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCAMP43121 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCAMP43121 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCAMP43121 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCAMP43121 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCAMP43121 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCAMP43121 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCAMP43121 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MCAMP43121 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCAMP43121 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MCAMP43121 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCAMP43121 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCAMP43121 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCAMP43121 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCAMP43121 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCAMP43121 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MCAMP43121 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MCAMP43121 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCAMP43121 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCAMP43121 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCAMP43121 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCAMP43121 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCAMP43121 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCAMP43121 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MCAMP43121 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms