Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms